Milli Eğitim Bakanlığımızın, eğitim politikaları ve stratejik planlarını, mevzuat ve programlar doğrultusunda yönetmek, yönlendirmek, denetlemek ve koordine ederek etkin ve verimli bir şekilde yerine getirme iş ve işlemlerini yürütür. Bu Kapsamda; daha iyi ve daha etkin bir hizmet yürütebilmek için; şube müdürlükleri şeklinde alt birimler oluşturulmuştur.

a) Temel Eğitim Şubesi: Okul Öncesi, İlkokul ve Ortaokul ile ilgili iş ve işlemleri yürütür.
b) Ortaöğretim Şubesi: Ortaöğretim ile ilgili iş ve işlemleri yürütür.
c) Mesleki ve Teknik Eğitim Şubesi: Mesleki ve Teknik Eğitim ile ilgili iş ve işlemleri yürütür.
ç) Din Öğretimi Şubesi: Din Öğretimi ile ilgili iş ve işlemleri yürütür.
d) Özel Eğitim ve Rehberlik Hizmetleri Şubesi: Özel Eğitim ve Rehberlik Hizmetleri ile ilgili iş ve işlemleri yürütür.
e) Hayat Boyu Öğrenme Şubesi: Halk Eğitimi ve Açıköğretim, Yaygın eğitim ile ilgili iş ve işlemleri yürütür.
f) Özel Öğretim Kurumları Şubesi; Bakanlığımıza bağlı tüm  Özel Öğretim Kurumları ile ilgili iş ve işlemleri yürütür.
g) Bilgi İşlem ve Ölçme Değerlendirme Sınav Şubesi: MEBBİS, e-Okul, DYS, Bakanlığımız tarafından yürütülen Merkezi Sistem Sınavları vb. iş ve işlemleri yürütür.
ğ) Strateji Geliştirme Şubesi: İhtiyaç analizleri yapmak, Hükümet Politikaları Çerçevesinde yeni ve etkin Stratejiler geliştirmek vb. iş ve işlemleri yürütür.
h) İnsan Kaynakları Yönetimi Şubesi: İnsan kaynaklarıyla ilgili kısa, orta ve uzun vadeli planlamalar yapmak, Norm kadro iş ve işlemlerini  vb. iş ve işlemleri yürütür.
ı) Destek Şubesi: Ders araç ve gereçleri ile donatım ihtiyaçlarını temin etmek, Sosyal Tesisler, Taşınır ve taşınmazlara ilişkin iş ve işlemler vb. iş ve işlemleri yürütür.
i)  İnşaat ve Emlak Şubesi: Yapım programları, İnşaat, Onarım, Kamulaştırma vb.   ile ilgili iş ve işlemleri yürütür.
j) Hukuk Şubesi: Adli ve idari davalar ile tahkim yargılaması ve icra işlemlerini yürütmek.